« Le Single Step est une nouvelle méthode d’indexation qui permet d’évaluer tous les animaux, mâles et femelles, qu’ils soient génotypés ou non, dans une seule évaluation avec l’ensemble de leurs informations disponibles : informations génomiques, performances, généalogies. Cette méthode peut être appliquée sur les deux filières bovines, sur toutes les races, même celles disposant de peu de génotypages, et sur tous les caractères y compris les nouveaux pour lesquels peu de performances sont encore enregistrées », explique l’Idele dans un communiqué.
Plusieurs années de développement logiciel
Dès 2017, l’équipe G2B de l'Inrae a engagé des travaux de recherche pour développer un logiciel permettant de mettre en œuvre le Single-Step. « Il devait couvrir les besoins des évaluations génomiques bovines, comme une flexibilité des modèles d’évaluation ou encore la possibilité de l’utiliser dans des processus de calculs en routine avec de très grandes quantités d’informations », explique l’Idele. Ce logiciel a ensuite été validé et optimisé par les partenaires de l’UMT eBis : Inrae, Idele et Allice, dans le cadre du programme Asap, financé par Apis-gene. Le logiciel a ensuite été mis à disposition de GenEval, pour mettre en œuvre la méthode Single Step dans les évaluations des bovins.
« Ce déploiement du Single Step est en lui-même un énorme défi. Il s’agit de mettre en place en quelques mois une nouvelle méthode d’évaluation pour tous les caractères et ce dans toutes les races bovines », explique l’Idele.
Les premiers index issus de la méthode du Single Step sont disponibles depuis le 8 mars pour les races bovines laitières au calendrier national, et le seront le 6 avril pour celles au calendrier international. Pour les bovins allaitants, il faudra attendre l’hiver 2023.
